Ao resgatarem uma jovem mutante chamada Jubileu, os X-Men travam contato com os Sentinelas, robôs criados para capturar mutantes. Magneto ataca uma base de mísseis e uma indústria química para se vingar do humanos. Wolverine reencontra seu antigo inimigo, Dentes-de-Sabre. Scott Summers e Jean Grey são sequestrados pelos Morlocks, mutantes de aparência desagradável que se exilaram nos túneis de New York. Tempestade, Gambit e Jubileu são mantidos como escravos na ilha de Genosha. Vampira procura pela Cura Mutante, e Apocalipse cria seus Quatro Cavaleiros e ataca a humanidade. Os X-Men confrontam o Fanático. Um viajante do futuro, Bishop vem para impedir que o assassinato do Senador Kelly leve a um futuro terrível para humanos e mutantes. Magneto se alia aos X-Men para impedir que as Sentinelas, comandadas pelo Molde-Mestre dominem a humanidade..
Jubileu é atacada por robôs chamados Sentinelas em um comércio local.
Os X-Men destroem arquivos sobre mutantes e escapam para o Pássaro Negro.
Ciclope, Tempestade e Wolverine combatem Magneto.
Magneto destrói uma fábrica de produtos químicos para atrair o Professor X.
Um grupo de mutantes chamado Morlocks capturam Jean e Ciclope.
Wolverine viaja ao Canadá em busca de refúgio na vida selvagem.
Tempestade, Jubileu e outros mutantes são tornados escravos.
Os X-Men encontram a Mansão X destruída.
Um médico alega ter encontrado uma cura para o gene mutante.
Apocalipse transforma mutantes nos Cavaleiros.
O mutante Bishop viaja no tempo do ano 2055 d.C. para o presente.
A Irmandade de Mutantes planeja assassinar o Senador Robert Kelly.
Molde-Mestre quer trocar os cérebros dos líderes mundiais por computadores.
Sr. Sinistro manipula Morfo para criar armadilhas.
Sr. Sinistro e seus capangas Nasty Boys sequestram Ciclope e Jean Grey.
Rei das Sombras atrai Tempestade para sua casa no Monte Kilimanjaro.
Ômega Vermelho é ressuscitado por três generais corruptos.
Wolverine se infiltra no quartel dos Amigos da Humanidade.